CDD ou CDI
Le LYSA-IM (groupe composé de médecins nucléaire et d’ingénieurs) a pour mission d’assurer une relecture centrale des données d’imagerie médicales (Tomographie, Tomodensitométrie…) pour répondre aux besoins des études cliniques du LYSARC. Ce groupe a aussi pour mission de mener des projets de recherches complémentaires pour améliorer la prise en charge des patients à l’aide des données issues des examens d’imagerie.
LYSA-IM participe actuellement à explorer et valider des nouveaux paramètres pronostics déterminés à partir de l’imagerie médicale, essentiellement la TEP. L’objectif étant de pouvoir extraire automatiquement ces nouveaux paramètres des images DICOM et de les associer potentiellement à des algorithmes d’intelligence artificielle pour renforcer l’interprétation médicale. Les paramètres à extraire sont par exemple le volume tumoral (segmentation de la tumeur pour déterminer le volume), la dispersion (distance entre les atteintes) et différents paramètres de géométrie et de texture, également appelés Radiomics.
Missions
Rattaché au directeur du département, une partie de vos missions seront liées à l’activité clinique du département, à savoir :
- Participer à la validation des outils spécifiques des projets et du département (participation à la mise en place de plateforme web de centralisations d’images, validation de systèmes informatisées, scénarii de tests…)
- Accompagner l’équipe dans le suivi des projets clinique
- Contrôler et organiser le flux des données d’imagerie médicales dans le cadre de leur archivage (outil PACS) et dans la réutilisation de ces données (datahub…)
L’autre partie de votre activité sera de développer des outils permettant d’automatiser l’extraction et le traitement de ces radiomics en créant des outils personnalisés aux besoins du LYSARC (méthode de développement agile). Pour cela, vous serez en interaction avec les ingénieurs du LYSA-IM et un médecin nucléaire expert dans le domaine, et vous devrez :
- Développer des outils permettant de pré-processer de la données DICOM (format imagerie médicale) comme la lecture d’imagerie, la transformation de la donnée (format Nifti), masque de segmentation…
- Participer au développement d’outil d’extraction et de calcul des paramètres radiomics (libraire pyRadiomics)
- Création d’interfaces homme-machine
- Organisation et export des données en format structuré (interopérabilité avec les outils existant du LYSARC pour la gestion des données)
- Accompagner les experts dans la réalisation de projets de recherches autour de l’utilisation des radiomics dans le lymphome
- Faciliter l’interopérabilité entre les différentes bases de données (imagerie, clinique, biologique, anatomopathologie…
Profil
Vous préparez une école d’ingénieur dans la recherche biomédicale et/ou de mathématiques appliquées et/ou en informatique orienté traitement d’images
Vous avez une notion de la norme DICOM et des outils de traitement d’images.
Avoir un intérêt pour le développement informatique est indispensable : Python, programmation orientée objet, tests unitaires.
Vous faites preuve d’esprit d’analyse, de synthèse et avez une bonne capacité d’auto-documentation.
Vous aimez travailler en équipe et êtes doté d’un bon sens de la communication.
Poste basé à l’Hôpital Henri Mondor à Créteil.
Poste basé à
Nous vous invitons à remplir le formulaire suivant et à adresser votre CV et lettre de motivation.