Immunologie Intégrative des Lymphocytes B

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Objectifs et thèmes de recherche

Comprendre comment les cellules tumorales de certains lymphomes B et T acquièrent ou détournent des fonctions immunitaires diverses en interaction avec leur micro-environnement.

Thèmes de recherche

L’équipe étudie l’hétérogénéité transcriptionnelle des cellules de lymphome et de leur micro-environnement immunitaire, par des approches de génomique sur cellules uniques associées à des analyses bioinformatiques à grande échelle.

MOTS-CLES

Centres germinatifs, lymphome folliculaire (FL), lymphome B diffus à grandes cellules (DLBCL), lymphome T angio-immunoblastique (AITL), single-cell RNA-seq, hétérogénéité transcriptionnelle, différenciation cellulaire

Pierre Milpied Chef d'équipe

Centre d’Immunologie de Marseille-Lumigny (CIML)

« Appartenir au consortium CALYM, c’est bénéficier de l’expertise scientifique, clinique et translationnelle des équipes partenaires et du staff CALYM, et accéder aux ressources exceptionnelles de la collection CeVi. Un soutien et des outils indispensables pour contribuer collectivement à la recherche sur les lymphomes. »

 Pierre Milpied
Expertise Immunologie Intégrative des Lymphocytes B
Expertise

  • Modèles murins de réponse immunitaire B antigène-spécifique
  • Modèles d’activation ex vivo de lymphocytes B et analyse transcriptionnelle haut-débit (RNA-seq, scRNA-seq)
  • Analyse / Tri de sous-populations de cellules tumorales primaires par cytométrie de flux
  • Analyse / Tri du micro-environnement immunitaire par cytométrie de flux
  • Analyses intégratives haut-débit sur cellules uniques (phénotype + transcriptome + répertoire BCR/TCR) par single-cell RNA-seq
  • Analyses bioinformatiques de données multi-modales haut-débit sur cellules uniques

Plateformes et ressources techniques

  • Plateformes de Génomique, Bioinformatique et Cytométrie du Centre d’Immunologie de Marseille-Luminy (CIML)

TOP 5 des dernières publications scientifiques

Calym FB5P-seq: FACS-based 5-prime end single-cell RNA-seq for integrative analysis of transcriptome and antigen receptor repertoire in B and T cells.
Attaf A, Cervera-Marzal I, Dong C, Gil L, Renand A, Spinelli L, Milpied P.
Front Immunol. 2020 Mar 3;11:216. doi: 10.3389/fimmu.2020.00216. En savoir plus
Calym Human germinal center transcriptional programs are de-synchronized in B cell lymphoma.
Milpied P*, Cervera-Marzal I, Mollichella ML, Tesson B, Brisou G, Traverse-Glehen A, Salles G, Spinelli L, Nadel B*. *co-corresponding author
Nat Immunol. 2018 Sep;19(9):1013-1024. doi: 10.1038/s41590-018-0181-4. En savoir plus
Calym High-dimensional single-cell analysis identifies organ-specific signatures and conserved NK cell subsets in humans and mice.
Crinier A, Milpied P, Escalière B, Piperoglou C, Galluso J, Balsamo A, Spinelli L, Cervera-Marzal I, Ebbo M, Girard-Madoux M, Jaeger S, Bollon E, Hamed S, Hardwigsen J, Ugolini S, Vély F, Narni-Mancinelli E, Vivier E.
. Immunity. 2018 Nov 20;49(5):971-986.e5. doi: 10.1016/j.immuni.2018.09.009. En savoir plus
Calym Premalignant cell dynamics in indolent B-cell malignancies
Milpied P, Nadel B, Roulland S.
Curr Opin Hematol. 2015 Jul;22(4):388-96. doi: 10.1097/MOH.0000000000000159. En savoir plus
Calym Class-switched memory B cells remodel BCRs within secondary germinal centers.
McHeyzer-Williams LJ*, Milpied PJ*, Okitsu SL, McHeyzer-Williams MG. *co-first author
Nat Immunol. 2015 Mar;16(3):296-305. doi: 10.1038/ni.3095. En savoir plus