Objectifs et thèmes de recherche
Comprendre comment les cellules tumorales de certains lymphomes B et T acquièrent ou détournent des fonctions immunitaires diverses en interaction avec leur micro-environnement.Thèmes de recherche
L’équipe étudie l’hétérogénéité transcriptionnelle des cellules de lymphome et de leur micro-environnement immunitaire, par des approches de génomique sur cellules uniques associées à des analyses bioinformatiques à grande échelle.
MOTS-CLES
Centres germinatifs, lymphome folliculaire (FL), lymphome B diffus à grandes cellules (DLBCL), lymphome T angio-immunoblastique (AITL), single-cell RNA-seq, hétérogénéité transcriptionnelle, différenciation cellulaire
Centre d’Immunologie de Marseille-Lumigny (CIML)
« Appartenir au consortium CALYM, c’est bénéficier de l’expertise scientifique, clinique et translationnelle des équipes partenaires et du staff CALYM, et accéder aux ressources exceptionnelles de la collection CeVi. Un soutien et des outils indispensables pour contribuer collectivement à la recherche sur les lymphomes. »
- Modèles murins de réponse immunitaire B antigène-spécifique
- Modèles d’activation ex vivo de lymphocytes B et analyse transcriptionnelle haut-débit (RNA-seq, scRNA-seq)
- Analyse / Tri de sous-populations de cellules tumorales primaires par cytométrie de flux
- Analyse / Tri du micro-environnement immunitaire par cytométrie de flux
- Analyses intégratives haut-débit sur cellules uniques (phénotype + transcriptome + répertoire BCR/TCR) par single-cell RNA-seq
- Analyses bioinformatiques de données multi-modales haut-débit sur cellules uniques
Plateformes et ressources techniques
- Plateformes de Génomique, Bioinformatique et Cytométrie du Centre d’Immunologie de Marseille-Luminy (CIML)